酶的分子结构与特殊功能酶
第二章 酶的分子结构与特殊功能酶
2.1 酶化学组成:单纯酶、结合酶、辅酶/辅基
单纯酶仅由氨基酸肽链构成,无额外辅助成分;结合酶由蛋白质部分(酶蛋白)与非蛋白辅助因子共同组成完整全酶,只有全酶具备催化活性,拆分后酶活力消失。
辅助因子分为两类:与酶蛋白共价结合、无法通过透析/超滤分离的称为辅基;以非共价键结合、可物理分离的称为辅酶。常见辅助因子包含金属离子、铁卟啉、B族维生素衍生物。
酶蛋白决定催化反应专一性,辅酶与辅基负责传递氢、电子或各类化学基团。
2.2 酶活性中心结构与作用原理
酶属于大分子物质,绝大多数氨基酸残基不参与底物结合,仅局部区域构成活性中心。
活性中心是酶表面的裂隙、凹陷空间,由多肽链折叠后空间靠近的氨基酸残基组成,包含两类必需基团:结合基团负责抓住底物,催化基团负责发生化学反应;部分基团同时兼具两种功能。
活性中心以外同样存在维持酶整体空间构象的必需基团;结合酶的辅助因子也是活性中心组成部分。酶的催化特异性完全由活性中心的空间结构与基团种类决定。
2.3 分子结构与催化专一性的关联
氨基酸一级序列决定酶的空间结构、活性中心形态,直接决定底物识别专一性。
以消化蛋白酶为例:糜蛋白酶、胰蛋白酶、弹性蛋白酶序列高度同源,均以丝氨酸为催化核心,但底物结合口袋氨基酸存在微小差异,因此分别特异性水解含芳香氨基酸、碱性氨基酸、短侧链氨基酸的肽键。口袋空间、电荷环境的细微区别,形成不同底物选择特性。
2.4 各类调节型功能酶详解
2.4.1 酶原、酶原激活及生理作用
酶原是无催化活性的酶前体,多存在于消化腺、凝血系统,分泌后在特定部位水解切除一段肽链,形成完整活性中心,该过程称为酶原激活。
典型例子:胃蛋白酶原、胰蛋白酶原、凝血因子。激活本质是特异性肽键断裂,暴露活性中心。
生理意义:保护合成细胞不被自身蛋白酶分解;仅在作用位点激活发挥功能。激活异常会引发疾病,如胰腺炎。
2.4.2 同工酶结构特点与临床诊断用途
同工酶:催化相同化学反应,但分子结构、理化性质、免疫特性不同的一类酶,分布于不同组织、细胞器。
以乳酸脱氢酶LDH为例,由H、M两种亚基组合形成5种四聚体,心肌、骨骼肌、肝脏同工酶谱差异明显。组织损伤时特定同工酶释放进入血液,检测血清同工酶可辅助诊断脏器病变。
2.4.3 别构酶与别构调节机制
别构酶多为多亚基四级结构寡聚酶,分子存在两个位点:催化底物的催化位点、结合调节物的别构位点。
别构激活剂结合后提升酶与底物亲和力;别构抑制剂降低亲和力。代谢通路终产物常作为别构抑制剂产生反馈抑制,自动调控代谢速度,因此别构酶也叫调节酶。催化位点与别构位点可在同一亚基或分属不同亚基。
2.4.4 修饰酶与共价修饰调节
修饰酶可在其他酶催化下发生共价基团修饰,快速切换活性/无活性状态,属于可逆调节。
最常见类型:磷酸化与去磷酸化;另有乙酰化、甲基化、尿苷酸化等。修饰反应具备级联放大效应,是体内快速调控代谢的重要方式,糖原磷酸化酶为典型代表。
2.4.5 多酶复合体、多酶体系、多功能酶
1.多酶复合体:多种酶紧密结合成稳定整体,解体则失去活性,前一反应产物直接作为下一个酶底物,反应高效连续,如丙酮酸脱氢酶复合体。
2.多酶体系:参与同一代谢通路的多种酶共存于同一空间,但无物理结合,如糖酵解全部胞液酶。
3.多功能酶:单条多肽链包含多个独立活性中心,可催化多步连续反应,进化上效率更高,例如脂肪酸合成酶、大肠杆菌DNA聚合酶Ⅰ。
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